目前图书馆主要利用层数为二楼、三楼，二楼为全开架休闲区域，分为文学资料区、期刊奶茶区、懒人书吧、党史党建学堂、党建书屋、经管资料室、交旅资料室、工信资料室，主题墙等，在方便相关学院的学生查找专业书籍同时可以让读者休憩放松。三楼则为主要藏书架，按照传统二十二大类图书分类法排列，除此之外设有三个书库、馆长办公室、医学资料室。

云南商务职业学院图书馆目前已采用现代化智慧图书馆模式，实现读者自主借还图书、搜索查找在馆书籍、有声资源下载、观影游览等功能。